RNAct
 ID: | |
| 名称: | |
| 別称: | ― |
| URL: | |
| 運用機関名: | Centre for Genomic Regulation (CRG) |
| 運用機関所在国・地域: | スペイン |
| 説明: | モデル生物におけるタンパク質–RNA相互作用のデータベースです。実験データもしくはSONAR やcatRAPID (protein–RNA interaction prediction algorithm)による予測から得られたタンパク質–RNA相互作用に関連して、タンパク質についてはUniProt番号、遺伝子名、アミノ酸数、タンパク質の説明を、RNAについてはEnsembl Transcript ID、遺伝子名、転写ID、塩基対数などを収録しています。また相互作用について転写サポートレベル、予測スコアなども収録しています。タンパク質からとRNAからの検索が可能です。 |
| 生物種: | , , |
| タグ （対象）: | RNA, タンパク質 |
| タグ (データの種類): | 配列, 相互作用/パスウェイ |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | PubMed ID: DOI: |
| 言語: | 英語 |
| 稼動状況: | 稼動中 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | http://rnact.crg.eu/download |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明: | ― |
| データベースの利用許諾へのリンク: | http://rnact.crg.eu/about |
| データベースの使い方 | ― |
| データベースの連絡先: | http://rnact.crg.eu/about |
| API / SPARQL endpoint: | ― |
|
LSDBアーカイブへのリンク:
|
― |
|
MEDALSデータベース便覧へのリンク:
|
― |
|
統合TVへのリンク:
|
― |
|
FAIRsharingへのリンク:
|
― |
|
類似データベース:
|
RNAapt3D Networks of Functional Coupling of proteins SRPDB LncRRIsearch Interologous Interaction Database worm UTRome Noncoding RNA database LncACTdb 3.0 機能性RNAゲノムブラウザー The Signaling Gateway |
|
レコード管理者:
|
Integbio Database Catalog |
|
レコードの由来:
|
|
|
レコード公開日:
|
2020-04-14 |
|
レコード最終更新日:
|
2020-04-14 |
|
本レコードの利用条件:
|
Creative Commons CC0 license |