worm UTRome: C.elegans 3'UTR Database
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| 運用機関名: | Arizona State University |
| 運用機関所在国・地域: | アメリカ合衆国 |
| 説明: | 3'UTR（3'非翻訳領域）は、タンパク質やマイクロRNAのような非コードRNAとの相互作用によって転写後発現調節を行うための重要な部位です。 このデータベースは、線虫の3'UTR生物学の包括的リソースとして構築され、全mRNAの3'UTR構造に関する詳細な情報を提供しています。 解説およびキュレート配列、マイクロRNA結合サイトやPolyA付加の推定コンセンサスシグナルなど機能エレメントについての実験およびコンピュータ解析結果、 WormBaseやPicTarなど外部データベースのアノテーションが収録されています。 |
| 生物種: | |
| タグ （対象）: | RNA |
| タグ (データの種類): | 配列 |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | PubMed ID: DOI: PubMed ID: DOI: PubMed ID: DOI: PubMed ID: DOI: |
| 言語: | 英語 |
| 稼動状況: | 稼動中 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | http://tomato.biodesign.asu.edu/cgi-bin/UTRome/utrome.cgi?action=download |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明: | ― |
| データベースの利用許諾へのリンク: | ― |
| データベースの使い方 | ― |
| データベースの連絡先: | ― |
| API / SPARQL endpoint: | ― |
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LSDBアーカイブへのリンク:
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MEDALSデータベース便覧へのリンク:
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統合TVへのリンク:
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FAIRsharingへのリンク:
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類似データベース:
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UTRdb Noncoding RNA database 機能性RNAゲノムブラウザー Recount DB tRNAdb miRBase snoRNABase The European ribosomal RNA Database GtRNAdb RNAct |
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レコード管理者:
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Integbio Database Catalog |
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レコードの由来:
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レコード公開日:
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2011-12-08 |
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レコード最終更新日:
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2016-03-28 |
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本レコードの利用条件:
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Creative Commons CC0 license |