Noncoding RNA database
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| 運用機関名: | Poznan University |
| 運用機関所在国・地域: | ポーランド |
| 説明: | 非コードRNAの配列と機能に関する情報を収集したデータベースです。真正細菌、古細菌、真核生物の99生物種について30,000以上の配列が登録されています。配列情報はGenBank、アノテーション情報はFANTOM3（マウス）、H-inviational Integrated Database（ヒト）、ゲノムマッピング情報はUCSCゲノムブラウザを用いています。細菌由来の低分子量細胞質RNA（scRNA）の配列とアノテーションはRfamデータベースを用いています。 microRNA、snoRNAや、rRNA、tRNA、snRNA、SPR RNAのようなハウスキーピングRNAについては収録していませんが、他のデータベースへのリンクがあります。 |
| 生物種: | , , |
| タグ （対象）: | RNA |
| タグ (データの種類): | 配列 |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | ― |
| 言語: | 英語 |
| 稼動状況: | 稼動中 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | ― |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明: | ― |
| データベースの利用許諾へのリンク: | ― |
| データベースの使い方 | ― |
| データベースの連絡先: | ― |
| API / SPARQL endpoint: | ― |
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LSDBアーカイブへのリンク:
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MEDALSデータベース便覧へのリンク:
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統合TVへのリンク:
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FAIRsharingへのリンク:
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類似データベース:
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機能性RNAゲノムブラウザー miRBase snoRNABase worm UTRome 5S Ribosomal RNA Database tRNAdb Recount DB Plant snoRNA Database GtRNAdb The European ribosomal RNA Database |
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レコード管理者:
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Integbio Database Catalog |
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レコードの由来:
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レコード公開日:
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2011-12-08 |
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レコード最終更新日:
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2017-01-30 |
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本レコードの利用条件:
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Creative Commons CC0 license |