LncACTdb 3.0
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| 別称: | ― |
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| 運用機関名: | College of Bioinformatics Science and Technology, Harbin Medical University |
| 運用機関所在国・地域: | 中国 |
| 説明: | ceRNAs (competing endogenous RNAs) の相互作用のデータベースです。手動でキュレート、もしくは予測されたceRNAsについて、ceRNAとなるRNAと、これらと結合するmiRNAの情報、由来生物種や組織・細胞株の情報、関連形質・疾患、実験方法、参考文献、機能に関する情報を収録しています。ceRNAsとしては、内因的に生成された分子（lncRNA、環状RNA、コード遺伝子、偽遺伝子を含む）および外因的に導入された分子（ウイルスRNA、人工的に操作されたRNAを含む）を含んでいます。予測されたceRNAと実験的に同定されたceRNAに分けて検索、ブラウズが可能です。また、疾患、バイオマーカーに絞り込んだ検索も可能です。ブラウズではceRNAのタイプや、ceRNA、miRNA、生物種、形質・疾患を選んでデータを絞ることができます。また、BLAST検索もできます。ユーザがRNA情報を入力して機能を閲覧したり、生存性解析、ceRNAネットワーク表示を行うツールや、発現プロファイルを入力して機能的なceRNAを探すツールなどの解析ツールも多数用意されています。 |
| 生物種: | |
| タグ （対象）: | ゲノム/遺伝子, RNA, 健康/疾患 |
| タグ (データの種類): | 表現型, 配列, 相互作用/パスウェイ |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | PubMed ID: DOI: PubMed ID: DOI: |
| 言語: | 英語 |
| 稼動状況: | 稼動中 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | http://bio-bigdata.hrbmu.edu.cn/LncACTdb/Lncact_down.jsp |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明: | ― |
| データベースの利用許諾へのリンク: | ― |
| データベースの使い方 | http://bio-bigdata.hrbmu.edu.cn/LncACTdb/lncact_help.jsp |
| データベースの連絡先: | http://bio-bigdata.hrbmu.edu.cn/LncACTdb/lncact_help.jsp |
| API / SPARQL endpoint: | ― |
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LSDBアーカイブへのリンク:
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MEDALSデータベース便覧へのリンク:
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統合TVへのリンク:
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FAIRsharingへのリンク:
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類似データベース:
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HumanNet miRo2 RNAct LncBook EDK ncRNA-eQTL LSD miRTarBase RhesusBase doRiNA |
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レコード管理者:
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Integbio Database Catalog |
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レコードの由来:
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レコード公開日:
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2020-06-09 |
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レコード最終更新日:
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2021-08-10 |
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本レコードの利用条件:
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Creative Commons CC0 license |