miRTarBase
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| 別称: | ― |
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| 運用機関名: | Institute of Bioinformatics and Systems Biology, National Chiao Tung University |
| 運用機関所在国・地域: | 台湾（台湾省/中華民国） |
| 説明: | 世界最大規模および最新のmiRNA-ターゲット相互作用 (miRNA-target interaction; MTI)を蓄積しているデータベースです。MTIの収集は、miRNAの機能解析研究に関する文献からテキストマイニングで自動抽出した後、手動で文献を調査しており、リポーターアッセイ、ウェスタンブロット、miRNAの過剰発現あるいはノックダウンのマイクロアレイ実験等で検証済みのものが収集されています。 現在、14生物種、669種のmiRNAと2,533件のターゲット遺伝子間の4,270件のMTIが登録されています。 |
| 生物種: | , , , , , , , , , , , , , |
| タグ （対象）: | ゲノム/遺伝子, RNA |
| タグ (データの種類): | 配列, 相互作用/パスウェイ, 画像/動画 |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | PubMed ID: DOI: |
| 言語: | 英語 |
| 稼動状況: | 稼動中 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | https://mirtarbase.cuhk.edu.cn/~miRTarBase/miRTarBase_2019/php/download.php |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明: | ― |
| データベースの利用許諾へのリンク: | https://mirtarbase.cuhk.edu.cn/~miRTarBase/miRTarBase_2019/cache/download/LICENSE |
| データベースの使い方 | ― |
| データベースの連絡先: | https://mirtarbase.cuhk.edu.cn/~miRTarBase/miRTarBase_2019/php/contact.php |
| API / SPARQL endpoint: | ― |
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LSDBアーカイブへのリンク:
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MEDALSデータベース便覧へのリンク:
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統合TVへのリンク:
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FAIRsharingへのリンク:
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https://fairsharing.org/biodbcore-000615 |
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類似データベース:
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TarBase EVmiRNA miRNEST PmiREN PmiRKB mirEX miRBase PolymiRTS doRiNA LncACTdb 3.0 |
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レコード管理者:
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Integbio Database Catalog |
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レコードの由来:
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レコード公開日:
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2012-11-26 |
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レコード最終更新日:
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2021-08-05 |
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本レコードの利用条件:
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Creative Commons CC0 license |