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PmiRKB: Plant microRNA Knowledge Base
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| 運用機関名: | Zhejiang University |
| 運用機関所在国・地域: | 中国 |
| 説明: | miRNAの4つの主要セクション (functional modules)から構成されている植物miRNA知識データベースです。対象生物はシロイヌナズナとイネです。(1) 「SNP」では、miRNA前駆体やmiRNA, 標的サイトに存在するSNP情報を提供しています。(2) 「Pri-miR」は、MPSS (Massively Parallel Signature Sequencing)データに基づく組織特異的なpri-miRNAの転写シグナル情報を提供しています。(3) 「MiR-Tar」は、PARE (Parallel Analysis of RNA Ends)データに基づく予測miRNA標的認識サイト内の開裂シグナル情報を提供しています。(4)「Seld-reg」は、PARE (Parallel Analysis of RNA Ends)データに基づくmiRNA前駆体のプロセシングとmiRNAによる自己制御の残余物シグナル情報を提供しています。 |
| 生物種: | , |
| タグ （対象）: | 遺伝的多様性, RNA |
| タグ (データの種類): | 配列 |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | PubMed ID: DOI: |
| 言語: | 英語 |
| 稼動状況: | 休止 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | ― |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明: | ― |
| データベースの利用許諾へのリンク: | ― |
| データベースの使い方 | ― |
| データベースの連絡先: | ― |
| API / SPARQL endpoint: | ― |
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LSDBアーカイブへのリンク:
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MEDALSデータベース便覧へのリンク:
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統合TVへのリンク:
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FAIRsharingへのリンク:
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類似データベース:
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PolymiRTS miRNEST miRBase miRTarBase EVmiRNA PmiREN Project Specific Custom Tracks - ncRNA.org mirEX VISDB LncBook |
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レコード管理者:
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Integbio Database Catalog |
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レコードの由来:
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レコード公開日:
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2012-11-26 |
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レコード最終更新日:
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2022-09-21 |
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本レコードの利用条件:
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Creative Commons CC0 license |