PmiREN: Plant miRNA ENcyclopedia
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| 運用機関名: | Beijing Agro-Biotechnology Research Center, BAAFS |
| 運用機関所在国・地域: | 中国 |
| 説明: | 植物における機能的なmiRNAの包括的なデータベースです。 緑藻から被子植物まで180近くの種におけるmiRNA情報が集約されています。全ゲノムシークエンスとゲノムアノテーションはNCBI、Phytozome V12.1から、sRNA-SeqとPARE-SeqデータセットはNCBI GEO DataSetsから取得し、信頼度を付けてmiRNAを予測しています。 各レコードには、種名、miRNA遺伝子座のゲノム上位置、二次構造と配列、miRNAクラスター情報、シンテニックブロック情報、miRNAの器官における発現レベル、標的遺伝子情報が含まれます。 生物種ツリーからのブラウズや、miRNA識別子、キーワード、配列、ゲノム位置、クラスター、発現部位、シンテニックブロック、ターゲット遺伝子などを使用した検索が可能です。 |
| 生物種: | , |
| タグ （対象）: | ゲノム/遺伝子, RNA, 個体/種 |
| タグ (データの種類): | 配列, 発現, 局在 |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | PubMed ID: DOI: PubMed ID: DOI: PubMed ID: DOI: |
| 言語: | 英語 |
| 稼動状況: | 稼動中 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | https://www.pmiren.com/download |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明: | ― |
| データベースの利用許諾へのリンク: | https://www.pmiren.com/news?ID=5 |
| データベースの使い方 | ― |
| データベースの連絡先: | https://www.pmiren.com/contact |
| API / SPARQL endpoint: | ― |
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LSDBアーカイブへのリンク:
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MEDALSデータベース便覧へのリンク:
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統合TVへのリンク:
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FAIRsharingへのリンク:
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類似データベース:
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mirEX SEAweb EVmiRNA liqDB miRTarBase TodoFirGene miRNEST miRBase DropViz PmiRKB |
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レコード管理者:
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Integbio Database Catalog |
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レコードの由来:
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レコード公開日:
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2021-10-27 |
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レコード最終更新日:
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2021-10-27 |
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本レコードの利用条件:
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Creative Commons CC0 license |