LncBook
 ID: | |
| 名称: | |
| 別称: | ― |
| URL: | |
| 運用機関名: | BIG Data Center, Beijing Institute of Genomics, Chinese Academy of Sciences |
| 運用機関所在国・地域: | 中国 |
| 説明: | Long non-coding RNAs (lncRNAs)とオミクスデータ、機能情報、疾患とを関連づけるデータベースです。ヒトのlncRNAデータをGENCODE v27、NONCODE v5.0、LNCipedia v4.1、MiTranscriptome betaから収集し、コード情報、塩基配列、ゲノムブラウザー、発現、メチル化、変異、LncRNA-miRNA 相互作用、疾患に関する情報を統合しています。転写、疾患、機能などからの絞り込みが可能です。BLAST、コーディング予測、ゲノム位置アノテーションのツールも備えています。 |
| 生物種: | |
| タグ （対象）: | ゲノム/遺伝子, 遺伝的多様性, RNA, 健康/疾患 |
| タグ (データの種類): | 配列, 発現, 相互作用/パスウェイ |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | PubMed ID: DOI: |
| 言語: | 英語 |
| 稼動状況: | 稼動中 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | ftp://download.big.ac.cn/lncbook |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明: | ― |
| データベースの利用許諾へのリンク: | https://bigd.big.ac.cn |
| データベースの使い方 | ― |
| データベースの連絡先: | https://bigd.big.ac.cn/lncbook/contact |
| API / SPARQL endpoint: | ― |
|
LSDBアーカイブへのリンク:
|
― |
|
MEDALSデータベース便覧へのリンク:
|
― |
|
統合TVへのリンク:
|
― |
|
FAIRsharingへのリンク:
|
https://fairsharing.org/biodbcore-001262/ |
|
類似データベース:
|
SyntDB NONCODE LncACTdb 3.0 miRNEST ncRNA-eQTL VISDB LncRRIsearch Green Non-Coding Database iDog Digenic diseases database |
|
レコード管理者:
|
See the corresponding part in the FAIRsharing record. |
|
レコードの由来:
|
 (2020-09-07)
|
|
レコード公開日:
|
2020-09-08 |
|
レコード最終更新日:
|
2024-05-09 |
|
本レコードの利用条件:
|
Creative Commons Attribution and Share-alike (CC-BY-SA) International 4.0 license |