ncRNA-eQTL
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| 運用機関名: | Huazhong Agricultural University, College of Informatics |
| 運用機関所在国・地域: | 中国 |
| 説明: | ヒトのncRNA（non-coding RNA）発現に影響を与えるSNPに関する情報のデータベースです。TCGA (The Cancer Genome Atlas) のデータから、33種類のがんそれぞれについて、ncRNA発現量に関連すると特定されたeQTLと影響を受ける遺伝子のペアの位置、アレルごとの発現量分布、相関係数、P値などが収録されています。患者の寿命やGWASの連鎖不平衡と関係のあるeQTLも収録されており、がんの種類、Gene ID、SNP IDから各データを検索しダウンロードすることが可能です。 |
| 生物種: | |
| タグ （対象）: | ゲノム/遺伝子, RNA, 遺伝的多様性, 健康/疾患 |
| タグ (データの種類): | 配列, 発現, 表現型, 相互作用/パスウェイ |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | PubMed ID: DOI: |
| 言語: | 英語 |
| 稼動状況: | 稼動中 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | http://ibi.hzau.edu.cn/ncRNA-eQTL/download.php |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明: | ― |
| データベースの利用許諾へのリンク: | ― |
| データベースの使い方 | http://ibi.hzau.edu.cn/ncRNA-eQTL/help.php |
| データベースの連絡先: | http://ibi.hzau.edu.cn/ncRNA-eQTL/contact.php |
| API / SPARQL endpoint: | ― |
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LSDBアーカイブへのリンク:
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MEDALSデータベース便覧へのリンク:
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統合TVへのリンク:
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FAIRsharingへのリンク:
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類似データベース:
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LncBook CancerSplicingQTL SyntDB Pancan-meQTL BioXpress LncACTdb 3.0 iDog RhesusBase Bactome GeneNetwork |
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レコード管理者:
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Integbio Database Catalog |
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レコードの由来:
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レコード公開日:
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2021-08-24 |
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レコード最終更新日:
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2021-08-24 |
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本レコードの利用条件:
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Creative Commons CC0 license |