Bactome: bacterial genome database
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| 運用機関名: | Helmholtz Centre for Infection Research |
| 運用機関所在国・地域: | ドイツ |
| 説明: | 緑膿菌（Pseudomonas aeruginosa）の臨床分離株の情報を集めたデータベースです。各分離株の薬剤感受性や毒性などの表現型データに加え、遺伝子配列や発現情報が格納されています。Phenotype、Genome、Transcriptomeの各セクションから情報を検索することができます。pangenomeやSNPなどの情報を得たり、分離株毎の遺伝子発現情報をゲノムブラウザ上で比較して見ることが可能です。 |
| 生物種: | |
| タグ （対象）: | ゲノム/遺伝子, 遺伝的多様性, DNA, RNA, 健康/疾患 |
| タグ (データの種類): | 表現型, 配列, 発現, 画像/動画 |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | PubMed ID: DOI: |
| 言語: | 英語 |
| 稼動状況: | 稼動中 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | ― |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明: | ― |
| データベースの利用許諾へのリンク: | ― |
| データベースの使い方 | https://bactome.helmholtz-hzi.de/tutorial.html |
| データベースの連絡先: | https://bactome.helmholtz-hzi.de/cgi-bin/h-impre.cgi |
| API / SPARQL endpoint: | ― |
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LSDBアーカイブへのリンク:
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MEDALSデータベース便覧へのリンク:
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統合TVへのリンク:
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FAIRsharingへのリンク:
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類似データベース:
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Pseudomonas Genome Database V2 ncRNA-eQTL Leiden Open Variation Database Fungal and Oomycete genomics resource Oryza Tag Line Chickpea Portal DisGeNET: a database of gene-disease associations Mouse Phenome Database iDog MiGD |
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レコード管理者:
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Integbio Database Catalog |
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レコードの由来:
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レコード公開日:
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2019-10-01 |
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レコード最終更新日:
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2019-10-01 |
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本レコードの利用条件:
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Creative Commons CC0 license |