MiGD: Mikan Genome Database
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| 運用機関名: | 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構 (J-Globalへのリンク) |
| 運用機関所在国・地域: | 日本 |
| 説明: | ミカンゲノムデータベース（Mikan Genome Database: MiGD）はカンキツ育種のためのDNAマーカー開発支援を目的としたゲノムデータベースです。 ゲノムブラウザTASUKEを用いて、9種のカンキツのDNA多型情報を比較して見ることができます。 MiGDチームにより解読されたウンシュウミカン（C. unshiu）およびカラタチ（P. trifoliata）の全ゲノム配列と遺伝子アノテーション情報はゲノムブラウザJBrowseで閲覧できる他、ダウンロードも可能です。 CAPSマーカーデータベースには約2,700種類のCAPSマーカーのプライマー配列やC. unshiuおよびP. trifoliataのゲノム上の位置情報などが収録されています。 また、4種のカンキツゲノムに対してのBLAST検索も可能です。 |
| 生物種: | , , , , , , , |
| タグ （対象）: | ゲノム/遺伝子, 遺伝的多様性, DNA |
| タグ (データの種類): | 配列 |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | PubMed ID: DOI: |
| 言語: | 英語 |
| 稼動状況: | 稼動中 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | https://mikan.dna.affrc.go.jp/data_download/index.html |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明: | ― |
| データベースの利用許諾へのリンク: | https://mikan.dna.affrc.go.jp/about.html#Copyright |
| データベースの使い方 | ― |
| データベースの連絡先: | NIFTS_inq[at]naro[dot]affrc[dot]go[dot]jp |
| API / SPARQL endpoint: | ― |
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LSDBアーカイブへのリンク:
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MEDALSデータベース便覧へのリンク:
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統合TVへのリンク:
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FAIRsharingへのリンク:
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類似データベース:
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Transmembrane Helices in Genome Sequences Drosophila polymorphism database PCR Primer Database for Gene Expression Detection and Quantification Chicken Variation Database Beijing Genomics Institute Rice Information System PSSRdb Rhodococcus genome Project YanHuang - YH1 Genome Database Mum GARDEN DBcherry |
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レコード管理者:
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Integbio Database Catalog |
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レコードの由来:
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レコード公開日:
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2020-11-24 |
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レコード最終更新日:
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2020-11-24 |
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本レコードの利用条件:
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Creative Commons CC0 license |