LncRRIsearch
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| 運用機関名: | 産総研・早大 生体システムビッグデータ解析 オープンイノベーションラボラトリ |
| 運用機関所在国・地域: | 日本 |
| 説明: | long non-coding RNA(lncRNA)-mRNAまたはlncRNA-lncRNA間の相互作用の網羅的な予測をするためのウェブサーバーです。予測されるローカルな塩基対相互作用について、クエリとターゲットの情報（Gene ID、Transcript ID、染色体上位置、転写長など）、塩基対同士の距離、組織ごとの発現量、細胞内の局在状況、全体的な相互作用のエネルギー、相互作用する局所的配列の情報などを提供します。 遺伝子/代謝物名や，組織特異的発現パターン，RNA転写物の細胞内局在で検索することができます。現在ヒトおよびマウスのデータが利用可能です。 |
| 生物種: | , |
| タグ （対象）: | RNA, ゲノム/遺伝子 |
| タグ (データの種類): | 相互作用/パスウェイ, 配列, 発現, 局在 |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | PubMed ID: DOI: |
| 言語: | 英語 |
| 稼動状況: | 稼動中 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | ― |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明: | ― |
| データベースの利用許諾へのリンク: | ― |
| データベースの使い方 | http://rtools.cbrc.jp/LncRRIsearch/help.cgi |
| データベースの連絡先: | ― |
| API / SPARQL endpoint: | ― |
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LSDBアーカイブへのリンク:
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MEDALSデータベース便覧へのリンク:
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統合TVへのリンク:
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FAIRsharingへのリンク:
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類似データベース:
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snoDB SyntDB RNAct LncBook doRiNA microRNA.org MOROKOSHI Sorghum transcriptome database piRTarBase mirEX PmiREN |
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レコード管理者:
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Integbio Database Catalog |
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レコードの由来:
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レコード公開日:
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2020-03-31 |
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レコード最終更新日:
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2020-03-31 |
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本レコードの利用条件:
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Creative Commons CC0 license |