piRTarBase: piRNA targeting sites
 ID: | |
| 名称: | |
| 別称: | |
| URL: | |
| 運用機関名: | 国立成功大学 |
| 運用機関所在国・地域: | 中国 |
| 説明: | トランスポゾンをサイレンシングすることにより変異から動物ゲノムを保護する、小型非コードRNA（piRNA）のデータベースです。 C. elegansとC. briggsaeについて実験上または予測上piRNAターゲットサイトとされたmRNA上の部位の名称、量、ターゲット領域などを収録しており、piRNA、遺伝子名どちらからでも検索できます。また、mRNAの転写配列、遺伝子名、折りたたみの変化率（変異認識用）なども収録しています。 |
| 生物種: | , |
| タグ （対象）: | ゲノム/遺伝子, RNA |
| タグ (データの種類): | 配列, 発現, 相互作用/パスウェイ |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | PubMed ID: DOI: |
| 言語: | 英語 |
| 稼動状況: | 稼動中 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | http://cosbi6.ee.ncku.edu.tw/piRTarBase/download/ |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明: | http://cosbi6.ee.ncku.edu.tw/piRTarBase/download/ |
| データベースの利用許諾へのリンク: | ― |
| データベースの使い方 | http://cosbi6.ee.ncku.edu.tw/piRTarBase/tutorial/ |
| データベースの連絡先: | http://cosbi6.ee.ncku.edu.tw/piRTarBase/contact/ |
| API / SPARQL endpoint: | ― |
|
LSDBアーカイブへのリンク:
|
― |
|
MEDALSデータベース便覧へのリンク:
|
― |
|
統合TVへのリンク:
|
― |
|
FAIRsharingへのリンク:
|
― |
|
類似データベース:
|
piRBase microRNA.org doRiNA siRecords AceView genes Plant snoRNA Database Database of small human non-coding RNAs D3G BioXpress HEMM |
|
レコード管理者:
|
Integbio Database Catalog |
|
レコードの由来:
|
|
|
レコード公開日:
|
2020-01-21 |
|
レコード最終更新日:
|
2020-01-21 |
|
本レコードの利用条件:
|
Creative Commons CC0 license |