Networks of Functional Coupling of proteins: FunCoup
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| 運用機関名: | Stockholm Bioinformatics Center |
| 運用機関所在国・地域: | スウェーデン |
| 説明: | ゲノム全体の機能の関係性を推測するためのフレームワークです。タンパク質相互作用、mRNAやタンパク質の共発現、遺伝的相互作用機構の相同性、転写因子結合部位の共有など、物理的な相互作用だけではなく直接的間接的な調節や関与の情報も含んでいます。遺伝子名と生物種による検索が可能です。検索結果はネットワーク図、相互作用対象と関連の種類の一覧、もしくは関連要素の一覧として表示されます。
11のモデル生物におけるゲノムワイドな機能的結合を推測するためのフレームワークです。機能的結合または機能的会合は、非特異的な形の会合です。これには直接的な物理的相互作用が含まれますが、より一般的なタイプの直接または間接的な相互作用（調節相互作用またはそのプロセス、経路への参加など）も含まれます。 |
| 生物種: | , , , , , , , , , , |
| タグ （対象）: | ゲノム/遺伝子, タンパク質, RNA |
| タグ (データの種類): | 相互作用/パスウェイ |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | PubMed ID: DOI: PubMed ID: DOI: PubMed ID: DOI: |
| 言語: | 英語 |
| 稼動状況: | ― |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | ― |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明: | ― |
| 一括ダウンロードデータの利用条件: | ― |
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LSDBアーカイブへのリンク:
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MEDALSデータベース便覧へのリンク:
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統合TVへのリンク:
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FAIRsharingへのリンク:
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https://fairsharing.org/10.25504/FAIRsharing.qbwrtn |
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類似データベース:
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DIP KEGG LIGAND Database DBGET Search - RPAIR PINT SPIKE Automatic molecular interaction predictions Bacterial Protein Interaction Database ENCODE Project Human Protein-Protein Interaction rEference doRiNA |
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レコード管理者:
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See the corresponding part in the FAIRsharing record |
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レコードの由来:
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レコード公開日:
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2019-03-29 |
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レコード最終更新日:
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2019-03-29 |