OncoBase
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| 運用機関名: | Peking University Cancer Hospital and Institute, Chinese Academy of Sciences, University of Michigan |
| 運用機関所在国・地域: | 中国, アメリカ合衆国 |
| 説明: | がんに関わる体細胞変異の統合データベースです。TCGA、ICGC、COSMIC、ClinVarから収集した体細胞変異について、アノテーションを行なっています。局所的なクロマチンシグネチャー、異なる細胞タイプにおける3Dクロマチン相互作用、エンハンサーとターゲットのネットワーク再構築を統合しています。クロマチン相互作用から推定されたエンハンサーとプロモーターの相互作用は体細胞変異とターゲット遺伝子を定量的に優先順位づけするネットワーク拡散システムに統合されます。キーワード検索やJbrowseから閲覧できます。 |
| 生物種: | |
| タグ （対象）: | ゲノム/遺伝子, 遺伝的多様性, 細胞/オルガネラ, 健康/疾患 |
| タグ (データの種類): | 配列, 発現, 相互作用/パスウェイ |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | PubMed ID: DOI: |
| 言語: | 英語 |
| 稼動状況: | 稼動中 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | http://159.226.67.237/sun/oncobase/welcome/download.html |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明: | ― |
| データベースの利用許諾へのリンク: | ― |
| データベースの使い方 | http://159.226.67.237/sun/oncobase/welcome/documentation.html |
| データベースの連絡先: | http://159.226.67.237/sun/oncobase/welcome/contact.html |
| API / SPARQL endpoint: | ― |
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LSDBアーカイブへのリンク:
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MEDALSデータベース便覧へのリンク:
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統合TVへのリンク:
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FAIRsharingへのリンク:
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類似データベース:
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HACER neXtProt Stem Cell Commons HaploReg LncBook Nuclear Receptor Signaling Atlas ReMap Autism Knowledgebase CancerResource HmtVar |
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レコード管理者:
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Integbio Database Catalog |
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レコードの由来:
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レコード公開日:
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2019-11-19 |
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レコード最終更新日:
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2019-11-19 |
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本レコードの利用条件:
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Creative Commons CC0 license |
