Translocatome
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| 別称: | ― |
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| 運用機関名: | LINK-Group |
| 運用機関所在国・地域: | ハンガリー |
| 説明: | ヒトの細胞における転座タンパク質 (translocating proteins) に関するデータベースです。文献から手動でキュレートした局在、輸送メカニズム、生体活性、病理的役割、相互作用、構造特性などの情報をまとめています。ポジティブデータセットとネガティブデータセットを基にした機械学習による転座タンパク質予測も行っています。各タンパク質ごとに遺伝子名、Uniprot ID、Data-complexity score、Translocation evidence score、オルガネラでの局在、ComPPI databaseからの局在情報を収録しています。 |
| 生物種: | |
| タグ （対象）: | タンパク質 |
| タグ (データの種類): | 局在, 相互作用/パスウェイ |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | PubMed ID: DOI: |
| 言語: | 英語 |
| 稼動状況: | 稼動中 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | http://translocatome.linkgroup.hu/download |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明: | http://translocatome.linkgroup.hu/download |
| データベースの利用許諾へのリンク: | http://translocatome.linkgroup.hu/help/open-source |
| データベースの使い方 | ― |
| データベースの連絡先: | http://translocatome.linkgroup.hu/help/open-source |
| API / SPARQL endpoint: | ― |
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LSDBアーカイブへのリンク:
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MEDALSデータベース便覧へのリンク:
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統合TVへのリンク:
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FAIRsharingへのリンク:
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https://fairsharing.org/FAIRsharing.FL1LNB |
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類似データベース:
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EffectiveDB CropPAL Compartmentalized Protein-Protein Interaction PhaSepDB PINT ProteomicsDB VirusMentha Interologous Interaction Database pdbBAM Molecular INTeraction Database |
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レコード管理者:
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See the corresponding part in the FAIRsharing record. |
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レコードの由来:
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 (2021-06-28)
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レコード公開日:
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2021-06-30 |
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レコード最終更新日:
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2023-02-20 |
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本レコードの利用条件:
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Creative Commons Attribution and Share-alike (CC-BY-SA) International 4.0 license |