休止
(14日以上)
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pdbBAM
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| 名称: | |
| 別称: | ― |
| URL: | |
| 運用機関名: | 東北大学 大学院医学系研究科 附属創生応用医学研究センター (J-Globalへのリンク) |
| 運用機関所在国・地域: | 日本 |
| 説明: | PDBに含まれるタンパク質を配列相同性を用いてヒトゲノムにマッピングしたBAM形式ファイル（pdbBAM）をダウンロードして利用できます。pdbBAM をゲノムブラウザで読み込むことで、個人ゲノム解析結果とあわせてゲノム上のどこに、どの程度の数と類似度の立体構造情報があるかを可視化することができます。 |
| 生物種: | |
| タグ （対象）: | ゲノム/遺伝子, タンパク質 |
| タグ (データの種類): | 配列, 3D構造, 相互作用/パスウェイ, 局在 |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | ― |
| 言語: | 英語 |
| 稼動状況: | 休止 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | http://aoba.hgc.jp/pdbbam/download/ |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明: | http://aoba.hgc.jp/pdbbam/download/ |
| データベースの利用許諾へのリンク: | ― |
| データベースの使い方 | ― |
| データベースの連絡先: | ― |
| API / SPARQL endpoint: | ― |
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LSDBアーカイブへのリンク:
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MEDALSデータベース便覧へのリンク:
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統合TVへのリンク:
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FAIRsharingへのリンク:
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類似データベース:
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WCPDB PiSITE GTOP DOMMINO: A comprehensive database of macromolecular interactions Yeast Resource Center Public Data Repository GTOP (Rice version) Molecules To Go PreDom PDBSTR PhosphoSite Plus |
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レコード管理者:
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Integbio Database Catalog |
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レコードの由来:
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レコード公開日:
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2018-10-30 |
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レコード最終更新日:
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2018-10-30 |
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本レコードの利用条件:
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Creative Commons CC0 license |