休止
(14日以上)
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GTOP: Genomes To Protein structures and functions
情報・システム研究機構 国立遺伝学研究所 (J-Globalへのリンク) | |
日本 | |
ゲノムにコードされる全タンパク質の配列データを解析した結果をまとめたデータベースです。配列相同性解析を主な手段としており、立体構造予測(対PDBの配列相同性検索。Reverse PSI-BLASTを使用)、機能予測(対Swissprotの配列相同性検索。BLASTを使用)、モチーフ解析 (PROSITE)、ファミリー分類 (Pfam)、膜貫通ヘリックス予測 (SOSUI)、コイルドコイル予測 (Multicoil)、繰り返し配列解析 (RepAlign)の結果が収録されています。 | |
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タンパク質 | |
配列, 3D構造 | |
PubMed ID: DOI: PubMed ID: DOI: | |
英語 | |
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ftp://spock.genes.nig.ac.jp/pub/gtop/ | |
http://spock.genes.nig.ac.jp/~genome/mas-doc.html | |
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GTOP (Rice version) DB-SPIRE(アーカイブ) MobiDB PDBSTR SAHG (アーカイブ) RepeatsDB Sequence Navigator GPCRdb MIPModDB: A Central Resource for the Superfamily of Major Intrinsic Proteins InterEvol database |
Integbio Database Catalog | |
2011-12-08 | |
2018-12-05 | |
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