休止
(14日以上)
(14日以上)
CropPAL
 ID: | |
| 名称: | |
| 別称: | ― |
| URL: | |
| 運用機関名: | Australian National Data Service (ANDS), Edwards Group, University of Western Australia |
| 運用機関所在国・地域: | オーストラリア |
| 説明: | 様々な作物におけるタンパク質の細胞内局在をワンストップで調べることができるデータベースです。大規模スケールのMS/MS（質量分析）結果、蛍光タグ実験の結果、ナズナの実験的タンパク質-タンパク質相互作用から推測されるタンパク質-タンパク質相互作用のデータが含まれています。cropPAL2になり、タンパク質の細胞内局在をバイオインフォマティクスで予測したデータと、予測と実験データを共に考慮に入れたコンセンサスな局在情報も含んでいます。キーワード検索やオルガネラを選ぶことで目的タンパク質とその細胞内局在を調べることができます。相互BLAST と EnsemblPLants の相同性ツリーにより、種々作物横断的に局在を検索することや、SUBA の Arabidopsis データと比較することもできます。 |
| 生物種: | , , , |
| タグ （対象）: | タンパク質, 細胞/オルガネラ |
| タグ (データの種類): | 局在, 相互作用/パスウェイ |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | PubMed ID: DOI: |
| 言語: | 英語 |
| 稼動状況: | 休止 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | ― |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明: | ― |
| データベースの利用許諾へのリンク: | ― |
| データベースの使い方 | ― |
| データベースの連絡先: | ― |
| API / SPARQL endpoint: | ― |
|
LSDBアーカイブへのリンク:
|
― |
|
MEDALSデータベース便覧へのリンク:
|
― |
|
統合TVへのリンク:
|
― |
|
FAIRsharingへのリンク:
|
https://fairsharing.org/10.25504/FAIRsharing.p7btsb |
|
類似データベース:
|
Compartmentalized Protein-Protein Interaction LocDB Translocatome EffectiveDB PhaSepDB MiCroKiTS PCoM YeastRGB Haemosphere Yeast Resource Center Public Data Repository |
|
レコード管理者:
|
See the corresponding part in the FAIRsharing record. |
|
レコードの由来:
|
 (2018-12-21)
|
|
レコード公開日:
|
2019-03-28 |
|
レコード最終更新日:
|
2019-07-02 |
|
本レコードの利用条件:
|
Creative Commons Attribution and Share-alike (CC-BY-SA) International 4.0 license |