GENCODE
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| 運用機関名: | EMBL Heidelberg |
| 運用機関所在国・地域: | ドイツ |
| 説明: | GENCODEは、ヒトとマウスの全ゲノムの基本的なリファレンスゲノムアノテーション、およびそのアノテーションを維持・改善するためのツールとデータを提供しています。遺伝子セットは、包括的で、オルタナティブスプライシングによるアイソフォームや偽遺伝子を含むタンパク質コード領域・非コード領域を全て含みます。専門家の調査が必要な領域には手動でアノテーションしています。EnsemblやUCSCゲノムブラウザ、Tableブラウザで閲覧できる他、GENCODEサイト自体やFTPサイトから、またはAPIを利用してデータをダウンロードすることができます。 |
| 生物種: | , |
| タグ （対象）: | ゲノム/遺伝子 |
| タグ (データの種類): | 配列 |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | PubMed ID: DOI: |
| 言語: | 英語 |
| 稼動状況: | 稼動中 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | https://www.gencodegenes.org/human/, https://www.gencodegenes.org/mouse/ |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明: | https://www.gencodegenes.org/pages/data_format.html |
| データベースの利用許諾へのリンク: | https://www.gencodegenes.org/pages/data_access.html, https://www.ebi.ac.uk/about/terms-of-use/ |
| データベースの使い方 | https://www.gencodegenes.org/pages/data_access.html |
| データベースの連絡先: | https://www.gencodegenes.org/pages/contact.html |
| API / SPARQL endpoint: | http://asia.ensembl.org/info/data/mysql.html, http://asia.ensembl.org/info/docs/api/api_installation.html, http://rest.ensembl.org |
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LSDBアーカイブへのリンク:
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MEDALSデータベース便覧へのリンク:
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統合TVへのリンク:
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FAIRsharingへのリンク:
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類似データベース:
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TOT-DB Pseudogene.org HGD Burkholderia Genome DB The Vertebrate Genome Annotation Database SoybeanTFDB Neal's DNA Mutation Site Medaka Methylome Browser DAIZUbase HAL |
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レコード管理者:
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Integbio Database Catalog |
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レコードの由来:
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レコード公開日:
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2020-05-27 |
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レコード最終更新日:
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2020-05-27 |
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本レコードの利用条件:
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Creative Commons CC0 license |