休止
(14日以上)
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SoybeanTFDB
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| 名称: | |
| 別称: | ― |
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| 運用機関名: | 国立研究開発法人理化学研究所 横浜研究所 (J-Globalへのリンク) |
| 運用機関所在国・地域: | 日本 |
| 説明: | ダイズの全ゲノム配列 (Glyma1.0モデル)から転写因子と予測された遺伝子および網羅的なアノテーション情報を公開しています。現在のところ61ファミリーに分類される転写因子モデル5,035件をエンコードする遺伝子座4,342件が収録されています。 検索機能が優れており、転写因子ファミリーの名称やキーワード、遺伝子ID、GOターム、cis-モチーフなどで検索できます。BLASTによるホモロジー検索やゲノムブラウザによる表示、データのダウンロードも可能です。 |
| 生物種: | |
| タグ （対象）: | ゲノム/遺伝子 |
| タグ (データの種類): | 配列 |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | PubMed ID: DOI: |
| 言語: | 英語 |
| 稼動状況: | 休止 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | http://soybeantfdb.psc.riken.jp/download.pl |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明: | ― |
| データベースの利用許諾へのリンク: | ― |
| データベースの使い方 | ― |
| データベースの連絡先: | ― |
| API / SPARQL endpoint: | ― |
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LSDBアーカイブへのリンク:
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MEDALSデータベース便覧へのリンク:
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統合TVへのリンク:
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FAIRsharingへのリンク:
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類似データベース:
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LegumeTFDB Jatropha Genome Database Carnation DB DAIZUbase Eucalyptus camaldulensis Genome Database Zoysia Genome Database TOT-DB トレニア遺伝子データベース Eggplant Genome DataBase Acytostelium Gene Database |
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レコード管理者:
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Integbio Database Catalog |
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レコードの由来:
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レコード公開日:
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2013-01-27 |
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レコード最終更新日:
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2015-04-02 |
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本レコードの利用条件:
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Creative Commons CC0 license |