運用終了
TOT-DB: The Theileria orientalis Genome Annotation Database
 ID: | |
| 名称: | |
| 別称: | |
| URL: | |
| 運用機関名: | 北海道大学 人獣共通感染症リサーチセンター (J-Globalへのリンク) |
| 運用機関所在国・地域: | 日本 |
| 説明: | 寄生性原虫Theileria orientalisの全ゲノムを対象にしたデータベースです。G-integraプラットフォームのゲノムブラウザによって、発現データおよび遺伝子予測ソフトウェアからアノテーションされた遺伝子領域が表示されます。 病原性の強いT. parvaやT. annulataとのゲノム比較ができます。またゲノムブラウザ上で閲覧するだけではなく、BLASTによる相同性検索やデータの一括ダウンロードも行えます。全ゲノムの配列はホールゲノムショットガンと手動のギャップクロージング、自動および手動のアノテーションとを組み合わせて決定されています。 |
| 生物種: | , , |
| タグ （対象）: | ゲノム/遺伝子 |
| タグ (データの種類): | 配列 |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | PubMed ID: DOI: |
| 言語: | 英語 |
| 稼動状況: | 運用終了 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | http://totdb.czc.hokudai.ac.jp/download.html |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明: | ― |
| データベースの利用許諾へのリンク: | ― |
| データベースの使い方 | ― |
| データベースの連絡先: | ― |
| API / SPARQL endpoint: | ― |
|
LSDBアーカイブへのリンク:
|
― |
|
MEDALSデータベース便覧へのリンク:
|
http://medals.jp/list/detail/189.html |
|
統合TVへのリンク:
|
― |
|
FAIRsharingへのリンク:
|
― |
|
類似データベース:
|
HGD GENCODE DAIZUbase Medaka Methylome Browser KAIKObase SoybeanTFDB EnsemblProtists BGDB EnsemblPlants EnsemblFungi |
|
レコード管理者:
|
Integbio Database Catalog |
|
レコードの由来:
|
|
|
レコード公開日:
|
2013-07-29 |
|
レコード最終更新日:
|
2019-05-16 |
|
本レコードの利用条件:
|
Creative Commons CC0 license |