CancerSEA: Cancer Single-cell State Atlas
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| 運用機関名: | Harbin Medical University |
| 運用機関所在国・地域: | 中国 |
| 説明: | 25のがんタイプにおける、単一細胞レベルでの機能的な状態および遺伝子発現プロファイルを提供するデータベースです。シングルセルRNA-seqデータから情報を収集し、各細胞に14の機能的状態（stemness, invasion, metastasis, proliferationなど）およびタンパク質コード遺伝子・lncRNAの発現情報をアノテーションして格納しています。遺伝子名（リスト）を入力してがんタイプ毎の細胞機能との相関を見たり、細胞機能を選択して関連のある遺伝子リストを得たりすることができます。データのダウンロードも可能です。 |
| 生物種: | |
| タグ （対象）: | ゲノム/遺伝子, 遺伝的多様性, RNA, 細胞/オルガネラ, 健康/疾患 |
| タグ (データの種類): | 表現型, 配列, 発現, 分布, 分類 |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | PubMed ID: DOI: |
| 言語: | 英語 |
| 稼動状況: | 稼動中 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | http://biocc.hrbmu.edu.cn/CancerSEA/goDownload |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明: | ― |
| データベースの利用許諾へのリンク: | ― |
| データベースの使い方 | http://biocc.hrbmu.edu.cn/CancerSEA/goHelp |
| データベースの連絡先: | http://biocc.hrbmu.edu.cn/CancerSEA/goHelp |
| API / SPARQL endpoint: | ― |
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LSDBアーカイブへのリンク:
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MEDALSデータベース便覧へのリンク:
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統合TVへのリンク:
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FAIRsharingへのリンク:
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類似データベース:
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DropViz SAGD CellMarker liqDB CancerSplicingQTL Online GEne Essentiality database Haemosphere LncACTdb 3.0 LncRRIsearch snoDB |
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レコード管理者:
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Integbio Database Catalog |
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レコードの由来:
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レコード公開日:
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2019-10-01 |
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レコード最終更新日:
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2019-10-01 |
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本レコードの利用条件:
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Creative Commons CC0 license |