SwissRegulon
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| 運用機関名: | Swiss Institute of Bioinformatics (SIB), Switzerland |
| 運用機関所在国・地域: | スイス |
| 説明: | 遺伝子発現調節部位についてのゲノムワイドアノテーションを収載したデータベースです。モデル生物全体のプロモーター領域にある調節モチーフ、プロモーター、およびTF結合部位（TFBS）のゲノムワイドなアノテーションを行っています。予測は、次のものを含むインプットの組み合わせを、ベイズ確率論的に分析することで行われています。i) 実験により決定され、文献で報告された結合部位、ii) 転写因子の配列特異性であって既知のもの、iii) ChIP-chip データおよび ChIP-seq データ、iiii) オーソログノンコーディング領域のアラインメント |
| 生物種: | , , , , , , , , , , , , , , , , , , , |
| タグ （対象）: | ゲノム/遺伝子, エピジェネティクス |
| タグ (データの種類): | 配列, 発現, 相互作用/パスウェイ |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | PubMed ID: DOI: PubMed ID: DOI: |
| 言語: | 英語 |
| 稼動状況: | 稼動中 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | https://swissregulon.unibas.ch/sr/downloads |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明: | ― |
| データベースの利用許諾へのリンク: | ― |
| データベースの使い方 | ― |
| データベースの連絡先: | https://swissregulon.unibas.ch/sr/contact |
| API / SPARQL endpoint: | ― |
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LSDBアーカイブへのリンク:
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MEDALSデータベース便覧へのリンク:
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統合TVへのリンク:
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FAIRsharingへのリンク:
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https://fairsharing.org/biodbcore-000879 |
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類似データベース:
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Factorbook MethMotif Annotated regulatory Binding Sites from Orthologous Promoters DAnCER EWAS Atlas Plant Transcription Factor Database YPA NGS-QC PED CollecTF |
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レコード管理者:
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See the corresponding part in the FAIRsharing record. |
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レコードの由来:
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 (2021-05-24)
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レコード公開日:
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2021-05-26 |
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レコード最終更新日:
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2023-02-20 |
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本レコードの利用条件:
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Creative Commons Attribution and Share-alike (CC-BY-SA) International 4.0 license |