PED: Pancreatic Expression Database
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| 運用機関名: | Barts Cancer Institute |
| 運用機関所在国・地域: | イギリス |
| 説明: | 膵臓由来の遺伝学データを収録しているデータベースです。トランスクリプトーム、プロテオーム、メチレーション、miRNAの研究から得られる遺伝子発現データベースとゲノムの研究から得られるコピー数変異データベースの２つに分かれています。文献データベースには健常者膵臓、膵臓がん、膵臓の前駆病変（PanINs）、慢性膵炎から得られた組織、細針吸引液、体液由来の幅広い検体を対象とするデータが収録されており、サンプル情報（出所、採取、前処理、性別など）や転移部位（転移性サンプル）および患者コホート情報も含まれています。細胞株やモデルマウスを使った異なる治療やプロファイルの結果も収録しています。発現量データは健常と疾患との視覚的に比較が可能です。Ensembl Genes、Variation、Regulation、InterPro、PRIDEによるアノテーションも実施されています。 |
| 生物種: | , |
| タグ （対象）: | ゲノム/遺伝子, エピジェネティクス, 健康/疾患 |
| タグ (データの種類): | 発現, 書誌/ドキュメント |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | PubMed ID: DOI: PubMed ID: DOI: PubMed ID: DOI: PubMed ID: DOI: |
| 言語: | 英語 |
| 稼動状況: | 稼動中 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | ― |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明: | ― |
| データベースの利用許諾へのリンク: | ― |
| データベースの使い方 | ― |
| データベースの連絡先: | ― |
| API / SPARQL endpoint: | ― |
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LSDBアーカイブへのリンク:
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MEDALSデータベース便覧へのリンク:
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統合TVへのリンク:
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FAIRsharingへのリンク:
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https://fairsharing.org/biodbcore-001125/ |
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類似データベース:
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DAnCER Pancan-meQTL Integrative Disease Omics Database （iDOx DB） MIAMI DBKERO SwissRegulon Cell Model Passports EWAS Atlas P-DIRECT ゲノム解析データポータル UCSC Xena |
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レコード管理者:
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Integbio Database Catalog |
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レコードの由来:
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レコード公開日:
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2018-08-21 |
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レコード最終更新日:
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2018-08-21 |
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本レコードの利用条件:
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Creative Commons CC0 license |