運用終了
P-DIRECT ゲノム解析データポータル
 ID: | |
| 名称: | |
| 別称: | ― |
| URL: | |
| 運用機関名: | P-DIRECT |
| 運用機関所在国・地域: | 日本 |
| 説明: | 文部科学省 次世代がん研究シーズ戦略的育成プログラム (P-DIRECT) の「がん臨床シーズ育成グループ」が解析した、がん組織を含む様々なヒト試料についての全エクソンシーケンスなどの網羅的ゲノム・エピゲノム情報のポータルサイトです。 がん種ごとにまとめた、アミノ酸置換を伴う体細胞変異のリスト（メタデータ）をオープンデータとして公開しています。2015年6月現在、肺がん、脳腫瘍、白血病、骨髄異形成症候群、胸膜胚芽種のデータセットが収録されています。また、実際の研究プロジェクトにおけるがん症例毎の塩基配列データ（bamファイル、fastqファイルなど）は、バイオサイエンスデータベースセンターのNBDCヒトデータベース ( http://humandbs.biosciencedbc.jp ) から利用申請を必要とする制限付きで提供します。 P-DIRECTによるゲノム解析データポータルの運用は終了しましたが、ポータル運用時のデータセットのがん種、検体数、NBDCヒトデータベースIDがこちら （http://data-portal.jp/pdirect） でご覧になれます。本プロジェクトによる成果データの一部はNBDCヒトデータベース ( http://humandbs.biosciencedbc.jp )から制限付きで提供されており、「利用可能な研究データ一覧」の提供者情報内に「P-DIRECT」という記載が含まれています。 関連リンク：AMED 次世代がん医療創生研究事業（P-CREATE）: https://www.amed.go.jp/program/list/01/03/003.html |
| 生物種: | |
| タグ （対象）: | ゲノム/遺伝子, エピジェネティクス, 健康/疾患 |
| タグ (データの種類): | 配列, ポータル |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | ― |
| 言語: | 日本語 |
| 稼動状況: | 運用終了 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | http://p-direct.jp |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明: | ― |
| データベースの利用許諾へのリンク: | http://p-direct.jp |
| データベースの使い方 | ― |
| データベースの連絡先: | ― |
| API / SPARQL endpoint: | ― |
|
LSDBアーカイブへのリンク:
|
― |
|
MEDALSデータベース便覧へのリンク:
|
― |
|
統合TVへのリンク:
|
― |
|
FAIRsharingへのリンク:
|
― |
|
類似データベース:
|
P-CREATEゲノム解析データポータル Epigenome project portal site CEEHRC NETWORK PED Roadmap Epigenomics Project DAnCER NGSmethDB NBDC事業推進部 DBKERO Pancan-meQTL |
|
レコード管理者:
|
Integbio Database Catalog |
|
レコードの由来:
|
|
|
レコード公開日:
|
2015-06-30 |
|
レコード最終更新日:
|
2018-05-13 |
|
本レコードの利用条件:
|
Creative Commons CC0 license |