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P-DIRECT ゲノム解析データポータル
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文部科学省 次世代がん研究シーズ戦略的育成プログラム (P-DIRECT) の「がん臨床シーズ育成グループ」が解析した、がん組織を含む様々なヒト試料についての全エクソンシーケンスなどの網羅的ゲノム・エピゲノム情報のポータルサイトです。 がん種ごとにまとめた、アミノ酸置換を伴う体細胞変異のリスト(メタデータ)をオープンデータとして公開しています。2015年6月現在、肺がん、脳腫瘍、白血病、骨髄異形成症候群、胸膜胚芽種のデータセットが収録されています。また、実際の研究プロジェクトにおけるがん症例毎の塩基配列データ(bamファイル、fastqファイルなど)は、バイオサイエンスデータベースセンターのNBDCヒトデータベース ( http://humandbs.biosciencedbc.jp ) から利用申請を必要とする制限付きで提供します。 P-DIRECTによるゲノム解析データポータルの運用は終了しましたが、ポータル運用時のデータセットのがん種、検体数、NBDCヒトデータベースIDがこちら (http://data-portal.jp/pdirect) でご覧になれます。本プロジェクトによる成果データの一部はNBDCヒトデータベース ( http://humandbs.biosciencedbc.jp )から制限付きで提供されており、「利用可能な研究データ一覧」の提供者情報内に「P-DIRECT」という記載が含まれています。 関連リンク:AMED 次世代がん医療創生研究事業(P-CREATE): https://www.amed.go.jp/program/list/01/03/003.html | |
ゲノム/遺伝子, エピジェネティクス, 健康/疾患 | |
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2015-06-30 | |
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