Microbial Genome Annotation & Analysis Platform: MicroScope
Laboratoire d'Analyses Bioinformatiques pour la Genomique et le Metabolisme (LABGeM) | |
フランス | |
MicroScope は微生物の比較ゲノム解析と手動機能アノテーションのためのオンラインプラットフォームです。リレーショナルデータベーススキーマを用いて統語論的および機能的アノテーションパイプラインの事前計算結果、ならびに各ゲノムに固有のパスウェイツールおよび代謝解析を収録しています。 各ゲノム上の遺伝子について、類似配列、配列からの機能予測(InterProドメイン予測など)、代謝ネットワーク予測、実験からの機能予測など、遺伝子アノテーションを付与するための様々な情報を提供しています。ゲノムの解析とアノテーション、メタゲノム配列の解析とアノテーション、RNAseqデータのリファレンスゲノムへのマッピングと発現解析、異なる進化系統間のSNP/indelの抽出に利用できます。 | |
ゲノム/遺伝子 | |
配列, 相互作用/パスウェイ, 分類, オントロジー/用語/命名法 | |
PubMed ID: DOI: | |
英語 | |
稼動中 | |
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(2018-12-21) | |
2019-03-28 | |
2020-07-09 | |
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