PIR SuperFamily: PIRSF
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| 運用機関名: | Georgetown University Medical Center, PIR, University of Delaware, European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI) |
| 運用機関所在国・地域: | アメリカ合衆国 |
| 説明: | PIR SuperFamily （成分ドメインではなくタンパク質全体に基づく分類）のコンセプトを使用して、UniProtKB 配列を包括的かつ非重複的にクラスタリングし、進化の関係を表す階層的順序として提供するデータベースです。登録配列数、生物種の範囲、説明、ドメイン構造、機能と構造に関連するオントロジー、パスウェイなどのリンクを収録しています。 |
| 生物種: | |
| タグ （対象）: | タンパク質 |
| タグ (データの種類): | オントロジー/用語/命名法, 配列, 3D構造, 相互作用/パスウェイ, 分類 |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | PubMed ID: DOI: |
| 言語: | 英語 |
| 稼動状況: | 稼動中 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | ― |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明: | ― |
| データベースの利用許諾へのリンク: | ― |
| データベースの使い方 | ― |
| データベースの連絡先: | ― |
| API / SPARQL endpoint: | ― |
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LSDBアーカイブへのリンク:
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MEDALSデータベース便覧へのリンク:
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統合TVへのリンク:
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FAIRsharingへのリンク:
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https://fairsharing.org/10.25504/FAIRsharing.vssch2 |
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類似データベース:
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PreDom PROSITE UniLectin Sequence-Structural Templates of Single-member Superfamilies Microbial Genome Annotation & Analysis Platform Autophagy Database Structure, Interfaces and Alignments for Protein-Protein Interactions Database Eukaryotic Linear Motifs 3D interacting domains InterPro |
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レコード管理者:
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See the corresponding part in the FAIRsharing record. |
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レコードの由来:
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 (2018-12-21)
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レコード公開日:
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2019-03-28 |
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レコード最終更新日:
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2022-09-29 |
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本レコードの利用条件:
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Creative Commons Attribution and Share-alike (CC-BY-SA) International 4.0 license |