GreenPhylDB: A phylogenomic database for plant comparative genomics: GreenPhyl
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| 運用機関名: | International Cooperation Center for Agricultural Research for Development (CIRAD), Bioversity International, Generation Challenge Programme, South Green |
| 運用機関所在国・地域: | フランス |
| 説明: | 主要な植物門の進化に関する 37 種の完全ゲノムを含むデータベースです。位相同型の植物ファミリーを、広範かつ一貫した形で定義するため、これらのゲノムのクラスタリングを行いアノテーションしています。クラスターファミリーの配列、タンパク質ドメイン、タンパク質の一覧を収録しています。機能分類、生物種、転写因子などによるリストから検索が可能です。 |
| 生物種: | |
| タグ （対象）: | ゲノム/遺伝子, 個体/種 |
| タグ (データの種類): | 配列, 分類 |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | PubMed ID: DOI: |
| 言語: | 英語 |
| 稼動状況: | 稼動中 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | ― |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明: | ― |
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| データベースの使い方 | ― |
| データベースの連絡先: | ― |
| API / SPARQL endpoint: | ― |
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LSDBアーカイブへのリンク:
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MEDALSデータベース便覧へのリンク:
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統合TVへのリンク:
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FAIRsharingへのリンク:
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https://fairsharing.org/10.25504/FAIRsharing.j98570 |
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類似データベース:
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COGs RARTF TIGRFAMs PGF-DB HAMAP database of microbial protein families TreeFam PlantsT Evola ECRbase CoevDB |
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レコード管理者:
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See the corresponding part in the FAIRsharing record. |
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レコードの由来:
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 (2018-12-21)
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レコード公開日:
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2019-03-28 |
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レコード最終更新日:
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2020-07-09 |
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本レコードの利用条件:
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Creative Commons Attribution and Share-alike (CC-BY-SA) International 4.0 license |