TreeFam
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| 別称: | ― |
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| 運用機関名: | EMBL-EBI |
| 運用機関所在国・地域: | イギリス |
| 説明: | 動物のゲノムから推測される遺伝子の系統関係のデータベースです。種々の動物ゲノムの配列情報を用いて、オーソログやパラログについての信頼できるキュレーションされた情報を提供することを目的としています。 生物種間で保存されているドメインや機能、動物門での保存率、系統樹、相同配列などが収録されています。配列やキーワードによる検索が可能です。また、配列ファミリーの一覧や種の一覧、系統樹からのブラウズも可能です。検索データおよび全てのデータのダウンロードが可能です。 |
| 生物種: | , , , |
| タグ （対象）: | ゲノム/遺伝子, 個体/種 |
| タグ (データの種類): | 配列, 生物分類, 分類 |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | PubMed ID: DOI: PubMed ID: DOI: |
| 言語: | 英語 |
| 稼動状況: | 稼動中 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | http://www.treefam.org/download |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明: | http://www.treefam.org/download |
| データベースの利用許諾へのリンク: | http://www.ebi.ac.uk/about/terms-of-use |
| データベースの使い方 | ― |
| データベースの連絡先: | ― |
| API / SPARQL endpoint: | ― |
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LSDBアーカイブへのリンク:
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MEDALSデータベース便覧へのリンク:
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統合TVへのリンク:
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FAIRsharingへのリンク:
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類似データベース:
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CoevDB HOGENOM TreeBase GreenPhylDB: A phylogenomic database for plant comparative genomics RARTF PhylomeDB Molecular database for the identification of fungi OHNOLOGS GenomeSync Genome Project of Symbiobacterium thermophilum |
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レコード管理者:
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Integbio Database Catalog |
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レコードの由来:
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レコード公開日:
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2016-06-07 |
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レコード最終更新日:
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2020-03-12 |
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本レコードの利用条件:
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Creative Commons CC0 license |