休止
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CoevDB
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| 名称: | |
| 別称: | ― |
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| 運用機関名: | University of Lausanne |
| 運用機関所在国・地域: | スイス |
| 説明: | タンパク質コード遺伝子の分子内共進化のデータベースです。脊椎動物亜門のうち現存する真口類（bony vertebrates, Euteleostomi）の中の8,000以上のタンパク質ファミリーについて共進化の予測結果を格納しています。共進化の予測には独自に開発したCoevソフトウェアを使用しています。共進化スコアの高いペアサイトの数が多い順に遺伝子リストを見られるページや、遺伝子名を指定して検索し、全ての分子内共進化ペアサイトをスコアの高い順に表示させるページ等があります。またそれぞれのページから、系統樹の表示ができます。全データの一括ダウンロードも可能です。 |
| 生物種: | |
| タグ （対象）: | ゲノム/遺伝子, 個体/種 |
| タグ (データの種類): | 配列, 生物分類, 分類 |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | PubMed ID: DOI: |
| 言語: | 英語 |
| 稼動状況: | 休止 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | http://phylodb.unil.ch/CoevDB/?q=node/3 |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明: | ― |
| データベースの利用許諾へのリンク: | ― |
| データベースの使い方 | http://phylodb.unil.ch/CoevDB/?q=node/5 |
| データベースの連絡先: | ― |
| API / SPARQL endpoint: | ― |
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LSDBアーカイブへのリンク:
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MEDALSデータベース便覧へのリンク:
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統合TVへのリンク:
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FAIRsharingへのリンク:
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類似データベース:
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TreeFam HOGENOM OHNOLOGS Ancestral Genomes Evolutionary Genealogy of Genes: Non-supervised Orthologous Groups GreenPhylDB: A phylogenomic database for plant comparative genomics TreeBase PhylomeDB GenomeSync ECRbase |
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レコード管理者:
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Integbio Database Catalog |
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レコードの由来:
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レコード公開日:
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2019-10-09 |
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レコード最終更新日:
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2019-10-09 |
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本レコードの利用条件:
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Creative Commons CC0 license |