休止
(14日以上)
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CUBE-DB
 ID: | |
| 名称: | |
| 別称: | ― |
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| 運用機関名: | Evolution of Protein Structure and Function Group, Biomolecular Modelling and Design Division, Bioinformatics Institute |
| 運用機関所在国・地域: | シンガポール |
| 説明: | ヒトのタンパク質ファミリーにおける機能的分岐を検出するためのデータベースです。ヒトタンパク質のマルチメンバーファミリーに属するパラログタンパク質中の残基について、事前評価した保存スコアおよび専門化スコアを収録しています。タンパク質ファミリーの分類は、HUGO Gene Nomenclature Committee によって提案された分類に（ほぼ）従っています。オーソロガスなタンパク質配列のセットは、Ensembl から入手可能な完全脊椎動物ゲノムを用いて、 mutual-best-hit 戦略により生成されました。ドキュメントページに記述されているスコアは、個々のタンパク質の残基に割り当てられ、表形式（html またはダウンロード可能な xls 形式）で表示されると同時に、適切な場合には、関連する構造（Jmol、Pymol、Chimera）にマッピングされます。 |
| 生物種: | |
| タグ （対象）: | ゲノム/遺伝子 |
| タグ (データの種類): | 配列 |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | PubMed ID: DOI: PubMed ID: DOI: |
| 言語: | 英語 |
| 稼動状況: | 休止 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | ― |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明: | ― |
| データベースの利用許諾へのリンク: | ― |
| データベースの使い方 | ― |
| データベースの連絡先: | ― |
| API / SPARQL endpoint: | ― |
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LSDBアーカイブへのリンク:
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MEDALSデータベース便覧へのリンク:
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統合TVへのリンク:
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FAIRsharingへのリンク:
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https://fairsharing.org/10.25504/FAIRsharing.aqb4ne |
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類似データベース:
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Eucalyptus camaldulensis Genome Database HGD SoybeanTFDB IMGT/LIGM-DB Database of Eukaryotic Protein Encoding Genes (Xpro) Burkholderia Genome DB GENCODE The Vertebrate Genome Annotation Database IES MDS Database Neal's DNA Mutation Site |
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レコード管理者:
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See the corresponding part in the FAIRsharing record. |
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レコードの由来:
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 (2018-12-21)
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レコード公開日:
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2019-03-28 |
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レコード最終更新日:
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2019-06-17 |
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本レコードの利用条件:
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Creative Commons Attribution and Share-alike (CC-BY-SA) International 4.0 license |