Nucleic Acid Phylogenetic Profile: NAPP
Gautheret Lab, Institute for Integrative Biology of the Cell | |
フランス | |
配列決定された1000 以上の細菌ゲノムのリストに含まれる任意のゲノムから、RNAリッチのクラスターを検索することができるデータベースです。参照ゲノムの遺伝子間領域を、重なり合う50塩基毎のセグメントにタイル化し、全てのタイルとタンパク質コード配列を出現プロファイルに基づいて分類しています。RNA リッチのクラスターは個別に見ることができる他、RNA リッチクラスターの全てのタイルを大きな要素へと連結し、ゲノムブラウザ、または他の予測/RNA配列実験との比較に使用するための CSV または GFF ファイルとして抽出することができます。 | |
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RNA | |
分類, 配列 | |
PubMed ID: DOI: PubMed ID: DOI: | |
英語 | |
稼動中 | |
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https://fairsharing.org/10.25504/FAIRsharing.vr52p3 | |
AREsite Rfam snOPY UMASS Amherst Yeast snoRNA Database Noncoding RNA database Gclust Server COGs RBPDB 機能性RNAゲノムブラウザー worm UTRome |
See the corresponding part in the FAIRsharing record. | |
(2018-12-21) | |
2019-03-28 | |
2024-07-28 | |
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