Gclust Server
 ID: | |
| 名称: | |
| 別称: | ― |
| URL: | |
| 運用機関名: | 東京大学 大学院総合文化研究科 (J-Globalへのリンク) |
| 運用機関所在国・地域: | 日本 |
| 説明: | Gclustデータベースは系統プロファイルによる検索を可能にした相同タンパク質データベースです。95生物種の全タンパク質の総当たりBLASTの結果に基づき、類似度の閾値を自動的に設定しながら相同タンパク質の分類を行います。機能未知タンパク質についても相同クラスタができるため、着目する生物群に特有の相同クラスタを見つけることにより、それら生物群に固有の生理機能にかかわるタンパク質を発見する手がかりが得られます（系統プロファイリング）。 |
| 生物種: | , , , |
| タグ （対象）: | タンパク質 |
| タグ (データの種類): | 配列, 分類 |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | PubMed ID: DOI: PubMed ID: DOI: PubMed ID: DOI: |
| 言語: | 英語 |
| 稼動状況: | 稼動中 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | http://gclust.c.u-tokyo.ac.jp/Gclust_Download.html |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明: | ― |
| データベースの利用許諾へのリンク: | http://gclust.c.u-tokyo.ac.jp/Gclust_Download.html |
| データベースの使い方 | ― |
| データベースの連絡先: | ― |
| API / SPARQL endpoint: | ― |
|
LSDBアーカイブへのリンク:
|
https://dbarchive.biosciencedbc.jp/jp/gclust/desc.html |
|
MEDALSデータベース便覧へのリンク:
|
― |
|
統合TVへのリンク:
|
― |
|
FAIRsharingへのリンク:
|
― |
|
類似データベース:
|
COGs Protein Cluster HAMAP database of microbial protein families MnM CluSTr PROSITE InterPro CyanoClust database Blocks PlantsT |
|
レコード管理者:
|
Integbio Database Catalog |
|
レコードの由来:
|
|
|
レコード公開日:
|
2011-12-08 |
|
レコード最終更新日:
|
2022-01-21 |
|
本レコードの利用条件:
|
Creative Commons CC0 license |