公開停止中
BISC: BInary SubComplex Database
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| 運用機関名: | University of California, Santa Cruz |
| 運用機関所在国・地域: | アメリカ合衆国 |
| 説明: | タンパク質間相互作用のデータベースです。構造生物学領域と機能ゲノム領域の橋渡しとなることを目的として、現在主流のタンパク間相互作用データベースに収録されているデータのなかで、モデリングの可能な部分複合体構造を対象にした検索機能を提供しています。このデータベースは以下の３つのパートで構成されています。 1. 既知の部分複合体構造の情報として、PDBの結晶構造から抽出された2量体部分構造およびその座標情報に基づいてPISAにより予測された生物学的多量体の情報を掲載。ホモダイマーはBISCHom、ヘテロダイマーはBISCHetに分けて収録されています。 2. モデリングの可能なタンパク質間相互作用の情報として、実験結果に基づいたタンパク質間相互作用データベースであるBioGRID、IntAct、HPRDのデータを対象に、BISCHomまたはBISCHetにある配列と類似するテンプレート構造を収録。 3. 構造の決定されていない相互作用についてはMolSurferやSCOTCH、PISAといったさまざまな検証プログラムによる実行結果を収録。 |
| 生物種: | ― |
| タグ （対象）: | タンパク質 |
| タグ (データの種類): | 配列, 相互作用/パスウェイ, 画像/動画, 3D構造 |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | PubMed ID: DOI: |
| 言語: | 英語 |
| 稼動状況: | 公開停止中 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | ― |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明: | ― |
| データベースの利用許諾へのリンク: | ― |
| データベースの使い方 | ― |
| データベースの連絡先: | ― |
| API / SPARQL endpoint: | ― |
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LSDBアーカイブへのリンク:
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MEDALSデータベース便覧へのリンク:
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統合TVへのリンク:
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FAIRsharingへのリンク:
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類似データベース:
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3D interacting domains Agile Protein Interactomes Dataserver Structure, Interfaces and Alignments for Protein-Protein Interactions Database Bactibase: database dedicated to bacteriocins PreDom EncoMPASS KnotProt: A database of proteins with knots and slipknots InterEvol database PSCDB PDBsum |
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レコード管理者:
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Integbio Database Catalog |
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レコードの由来:
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レコード公開日:
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2013-01-15 |
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レコード最終更新日:
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2018-09-30 |
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本レコードの利用条件:
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Creative Commons CC0 license |