PSCDB: Protein Structural Change DataBase
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| 運用機関名: | 名古屋大学大学院 情報科学研究科 (J-Globalへのリンク) |
| 運用機関所在国・地域: | 日本 |
| 説明: | タンパク質のリガンド結合に伴う立体構造変化を整理したデータベースです。各タンパク質について、リガンド結合時および非結合時の構造（PDBリンク）、機能（EC番号、CSA distance）、リガンド情報、構成する可動部位、非可動部位の情報などを収録しています。タンパク質の立体構造変化を運動の種類とリガンド結合部位との位置関係によって７つのクラスに分類しています。 |
| 生物種: | ― |
| タグ （対象）: | タンパク質 |
| タグ (データの種類): | 3D構造, 相互作用/パスウェイ |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | PubMed ID: DOI: PubMed ID: DOI: |
| 言語: | 英語 |
| 稼動状況: | 稼動中 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | https://dbarchive.biosciencedbc.jp/jp/pscdb/download.html |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明: | https://dbarchive.biosciencedbc.jp/data/pscdb/LATEST/README.html |
| データベースの利用許諾へのリンク: | https://dbarchive.biosciencedbc.jp/jp/pscdb/lic.html |
| データベースの使い方 | ― |
| データベースの連絡先: | ― |
| API / SPARQL endpoint: | ― |
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LSDBアーカイブへのリンク:
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https://dbarchive.biosciencedbc.jp/jp/pscdb/desc.html |
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MEDALSデータベース便覧へのリンク:
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統合TVへのリンク:
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FAIRsharingへのリンク:
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類似データベース:
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PiSITE DOMMINO: A comprehensive database of macromolecular interactions Protein-ligand affinity change upon mutation Protein Protein Interaction Inhibition Database 3D interacting domains M-CSA DTA DATABASE PreDom Protein Model Database Agile Protein Interactomes Dataserver |
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レコード管理者:
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Integbio Database Catalog |
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レコードの由来:
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レコード公開日:
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2016-12-13 |
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レコード最終更新日:
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2024-05-09 |
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本レコードの利用条件:
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Creative Commons CC0 license |