運用終了
TP Atlas: Targeted Proteins Atlas
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| 運用機関名: | 情報・システム研究機構 国立遺伝学研究所 (J-Globalへのリンク) |
| 運用機関所在国・地域: | 日本 |
| 説明: | TP Atlasは、ターゲットタンパク研究の各課題につき、Cell Illustratorを使って表現したネットワーク図をプラットフォームとして、 そこに登場するターゲットタンパク質やその構造などの詳細情報や論文情報を引き出せる「ターゲットタンパク研究成果データベース」です。シグナル伝達ネッ トワーク、酵素反応経路、化合物代謝など多様な生命現象を対象とする、基本的生命、医薬、食品環境3分野の35課題を網羅しています。（Cell Illustratorは東大医科研 宮野悟教授らのグループが開発したパスウェイ描画ソフトウェアです。） タンパク質間の相互関係、シグナル伝達経路などが研究テーマごとに模式的に示されており、ネットワーク図はダウンロードすることもできます。各タンパク質について、タンパク質の詳細情報（配列、構造）、遺伝子情報、文献情報へとリンクされています。ターゲットタンパク研究の各課題について、その背景、ハイライト、概要が簡潔にまとめられています。 |
| 生物種: | |
| タグ （対象）: | タンパク質, 代謝物, 細胞/オルガネラ, 健康/疾患 |
| タグ (データの種類): | 相互作用/パスウェイ, 画像/動画, 書誌/ドキュメント, 3D構造 |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | PubMed ID: DOI: |
| 言語: | 日本語, 英語 |
| 稼動状況: | 運用終了 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | http://www.tanpaku.org/tpatlas/ |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明: | http://www.tanpaku.org/networkDB/help/TP_Atlas_HELP.pdf |
| データベースの利用許諾へのリンク: | ― |
| データベースの使い方 | ― |
| データベースの連絡先: | ― |
| API / SPARQL endpoint: | ― |
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LSDBアーカイブへのリンク:
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https://dbarchive.biosciencedbc.jp/jp/tpatlas/desc.html |
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MEDALSデータベース便覧へのリンク:
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統合TVへのリンク:
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FAIRsharingへのリンク:
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類似データベース:
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AT Atlas BioSystems STING TP構造ギャラリー iNTRODB Pathguide iPfam TPプレスリリース（研究）一覧 SMPDB The human DEPhOsphorylation Database |
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レコード管理者:
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Integbio Database Catalog |
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レコードの由来:
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レコード公開日:
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2012-07-10 |
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レコード最終更新日:
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2022-12-11 |
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本レコードの利用条件:
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Creative Commons CC0 license |