運用終了
BioSystems
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| 名称: | |
| 別称: | ― |
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| 運用機関名: | National Center for Biotechnology Information |
| 運用機関所在国・地域: | アメリカ合衆国 |
| 説明: | 代謝パスウエイやシグナルパスウエイ、疾患やその他の生体内プロセスに関わる生体分子の相互作用セットを収集したデータベースです。現在は、KEGGとEcoCycデータベースのパスウエイを対象としています。各エントリーには、パスウエイ図、文献情報、遺伝子、タンパク質配列、化合物のデータが含まれています。 NCBIが提供するBioSystemsの運用は終了しました。 後継となるデータベースの情報やBioSystemsのFTPサイトの情報が以下のサイトに記載されています。 https://ncbiinsights.ncbi.nlm.nih.gov/2021/08/10/retire-biosystems-database/ |
| 生物種: | ― |
| タグ （対象）: | タンパク質, 健康/疾患, 代謝物, 細胞/オルガネラ |
| タグ (データの種類): | 相互作用/パスウェイ, 画像/動画, 書誌/ドキュメント |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | PubMed ID: DOI: |
| 言語: | 英語 |
| 稼動状況: | 運用終了 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | ftp://ftp.ncbi.nih.gov/pub/biosystems/ |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明: | ftp://ftp.ncbi.nih.gov/pub/biosystems/README.txt |
| データベースの利用許諾へのリンク: | https://www.ncbi.nlm.nih.gov/home/about/policies.shtml |
| データベースの使い方 | ― |
| データベースの連絡先: | ― |
| API / SPARQL endpoint: | ― |
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LSDBアーカイブへのリンク:
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MEDALSデータベース便覧へのリンク:
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統合TVへのリンク:
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https://togotv.dbcls.jp/result.html?type=manual&page=1&query=BioSystems |
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FAIRsharingへのリンク:
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https://fairsharing.org/biodbcore-000430 |
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類似データベース:
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Pathguide MetaCyc SMPDB BBID TP Atlas CancerProView EAWAG-BBD Pathway Interaction Database GON Kinase Pathway Database |
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レコード管理者:
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Integbio Database Catalog |
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レコードの由来:
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レコード公開日:
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2011-12-08 |
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レコード最終更新日:
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2022-05-11 |
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本レコードの利用条件:
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Creative Commons CC0 license |