SMPDB: Small Molecule Pathway Database
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| 運用機関名: | University of Alberta |
| 運用機関所在国・地域: | カナダ |
| 説明: | SMPDB(Small Molecule Pathway Database)は、350以上のヒトの小分子パスウエイを含む視覚的なデータベースです。これらのうち2/3以上のパスウエイ(>280)は他のパスウエイデータベースでは見つけることができません。 SMPDBは、メタボロミクス、トランスクリプトミクス、プロテオミクス、およびシステム生物学におけるパスウエイ解明や発見をサポートするために構築されています。 全てのパスウエイには、詳細な解説、文献情報、関連器官、細胞内コンパートメント、タンパク質補助因子、タンパク質局在、代謝物質局在、化学構造、タンパク質四次構造に関する情報が含まれています。代謝物質名、薬剤名、遺伝子/タンパク質名、SwissProt ID、GenBank ID、アフィメトリクスIDまたはAgilentマイクロアレイIDのリストをクエリーとして検索すると、該当するパスウエイのリストが作成され、マッチした分子をハイライト表示します。 |
| 生物種: | |
| タグ （対象）: | タンパク質, 代謝物 |
| タグ (データの種類): | 相互作用/パスウェイ, 画像/動画 |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | PubMed ID: DOI: |
| 言語: | 英語 |
| 稼動状況: | 稼動中 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | http://smpdb.ca/downloads |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明: | http://smpdb.ca/downloads |
| データベースの利用許諾へのリンク: | http://smpdb.ca/about#citing |
| データベースの使い方 | ― |
| データベースの連絡先: | ― |
| API / SPARQL endpoint: | ― |
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LSDBアーカイブへのリンク:
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MEDALSデータベース便覧へのリンク:
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統合TVへのリンク:
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FAIRsharingへのリンク:
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https://fairsharing.org/biodbcore-000352 |
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類似データベース:
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MetaCyc Pathguide BioSystems EAWAG-BBD CancerProView Rhea Kinase Pathway Database Pathway Interaction Database KNApSAcK CobWeb (Alkaloid pathway) KNApSAcK Bicycle |
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レコード管理者:
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Integbio Database Catalog |
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レコードの由来:
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レコード公開日:
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2011-12-08 |
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レコード最終更新日:
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2012-10-01 |
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本レコードの利用条件:
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Creative Commons CC0 license |