運用終了
iPfam
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| 名称: | |
| 別称: | ― |
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| 運用機関名: | Howard Hughes Medical Institute |
| 運用機関所在国・地域: | アメリカ合衆国 |
| 説明: | タンパク質ファミリーに関する物理的相互作用のデータベースです。Protein DataBank（PDB）から抽出した既知タンパク質構造から計算されたタンパク質ドメイン間の相互作用、リガンドとの相互作用の情報を収録しています。また、リガンドの分子量、パートナードメインなども収録しています。タンパク質ドメインとリガンドそれぞれについてブラウズやアミノ酸配列による検索が可能です。 |
| 生物種: | ― |
| タグ （対象）: | タンパク質, 代謝物 |
| タグ (データの種類): | 3D構造, 相互作用/パスウェイ |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | PubMed ID: DOI: |
| 言語: | 英語 |
| 稼動状況: | 運用終了 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | ― |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明: | ― |
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| データベースの使い方 | ― |
| データベースの連絡先: | ― |
| API / SPARQL endpoint: | ― |
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LSDBアーカイブへのリンク:
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MEDALSデータベース便覧へのリンク:
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統合TVへのリンク:
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FAIRsharingへのリンク:
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類似データベース:
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NLDB STING ProLINT 3D interacting domains Protein-ligand affinity change upon mutation PSCDB PiSITE Structure, Interfaces and Alignments for Protein-Protein Interactions Database DOMMINO: A comprehensive database of macromolecular interactions iNTRODB |
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レコード管理者:
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Integbio Database Catalog |
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レコードの由来:
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レコード公開日:
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2016-06-07 |
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レコード最終更新日:
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2019-09-26 |
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本レコードの利用条件:
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Creative Commons CC0 license |