PROSITE: Database of protein domains, families and functional sites
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| 運用機関名: | Swiss Institute of Bioinformatics |
| 運用機関所在国・地域: | スイス |
| 説明: | タンパク質のファミリーやドメインに関するデータベースで、主にUniProtKB/Swiss-Protエントリーのドメイン機能のアノテーションに使用されています。現在、1,000以上のファミリーやドメインに対して特徴的なパターンやプロファイルを収集しています。各ファミリーやドメインを解説した文書エントリーおよびプロファイルやパターンに基づいたProRuleエントリーで構成されています。ユーザーが入力した配列からドメインや機能部位を予測することもできます。 |
| 生物種: | ― |
| タグ （対象）: | タンパク質 |
| タグ (データの種類): | 配列, 分類 |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | PubMed ID: DOI: PubMed ID: DOI: PubMed ID: DOI: PubMed ID: DOI: PubMed ID: DOI: |
| 言語: | 英語 |
| 稼動状況: | 稼動中 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | ftp://ftp.expasy.org/databases/prosite/ |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明: | ― |
| データベースの利用許諾へのリンク: | http://prosite.expasy.org/prosite_license.html |
| データベースの使い方 | ― |
| データベースの連絡先: | ― |
| API / SPARQL endpoint: | ― |
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LSDBアーカイブへのリンク:
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MEDALSデータベース便覧へのリンク:
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統合TVへのリンク:
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FAIRsharingへのリンク:
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https://fairsharing.org/biodbcore-000527 |
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類似データベース:
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InterPro TIGRFAMs HAMAP database of microbial protein families PANDIT COGs ProDom PlantsT CyanoClust database Gclust Server Pfam |
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レコード管理者:
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Integbio Database Catalog |
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レコードの由来:
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レコード公開日:
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2011-12-08 |
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レコード最終更新日:
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2012-10-01 |
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本レコードの利用条件:
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Creative Commons CC0 license |
