Het-PDB Navi: A navigator of small molecules in Protein Data Bank which is called heterogen atoms or in short hetatoms
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| 運用機関名: | 長浜バイオ大学 (J-Globalへのリンク) |
| 運用機関所在国・地域: | 日本 |
| 説明: | タンパク質の立体構造がどのような低分子（ヘテロ原子）との共結晶で決定されているかを知ることを目的に、Protein Data Bank (PDB)にエントリーされているタンパク質と低分子の相互作用を収集したデータベースです。PDBに最も多く含まれている低分子は、カルシウム、亜鉛、マグネシウムなどの金属イオンであり、その次に糖分子やヌクレオチドが多く含まれています。これらの低分子は酵素の補因子として働いたり、タンパク質の構造安定化に寄与しています。 |
| 生物種: | ― |
| タグ （対象）: | タンパク質, 糖質, 脂質, 代謝物, 化学物質 |
| タグ (データの種類): | 相互作用/パスウェイ, 3D構造 |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | PubMed ID: DOI: |
| 言語: | 英語 |
| 稼動状況: | 稼動中 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | ― |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明: | ― |
| データベースの利用許諾へのリンク: | ― |
| データベースの使い方 | ― |
| データベースの連絡先: | ― |
| API / SPARQL endpoint: | ― |
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LSDBアーカイブへのリンク:
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MEDALSデータベース便覧へのリンク:
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統合TVへのリンク:
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FAIRsharingへのリンク:
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類似データベース:
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Ligand Expo ChEBI KEGG PATHWAY Database GlycoEpitope NLDB The Cambridge Structural Database 3D Lectin Database iPfam Chemical Component Dictionary Protein-Chemical Structural Interactions |
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レコード管理者:
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Integbio Database Catalog |
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レコードの由来:
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レコード公開日:
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2011-12-08 |
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レコード最終更新日:
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2012-10-01 |
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本レコードの利用条件:
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Creative Commons CC0 license |