MOROKOSHI Sorghum transcriptome database
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| 運用機関名: | 特定国立研究開発法人理化学研究所 環境資源科学研究センター (J-Globalへのリンク) |
| 運用機関所在国・地域: | 日本 |
| 説明: | モロコシ（Sorghum bicolor） の遺伝子発現データベースです。モロコシの植物体全体の５つの発生段階と花の３つの成長段階から、標準化された完全長cDNAライブラリを作成してESTを取得したデータと、穂、種子、茎の組織特異的なRNA-Seq のデータを収録しています。遺伝子のアノテーションやオルソログ、FL-cDNA cloneの情報、RNA-Seqによる発現パターン、同様の発現パターンを示す遺伝子、共発現ネットワークについて整理しています。遺伝子IDに加え、TAIR ID、Pfam ID、EC番号、KEGG orthology ID、Panther DB ID、機能についてのキーワードでも検索が可能です。 |
| 生物種: | |
| タグ （対象）: | ゲノム/遺伝子, cDNA/EST |
| タグ (データの種類): | 配列, 発現, 局在, 相互作用/パスウェイ |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | PubMed ID: DOI: |
| 言語: | 英語 |
| 稼動状況: | 稼動中 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | http://matsui-lab.riken.jp/morokoshi/Downloads.html |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明: | ― |
| データベースの利用許諾へのリンク: | ― |
| データベースの使い方 | ― |
| データベースの連絡先: | http://matsui-lab.riken.jp/morokoshi/Contact.html |
| API / SPARQL endpoint: | ― |
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LSDBアーカイブへのリンク:
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MEDALSデータベース便覧へのリンク:
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統合TVへのリンク:
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FAIRsharingへのリンク:
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類似データベース:
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SAGD Haemosphere LncRRIsearch Melonet DB snoDB ATTED-II Rubber Genome & Transcriptome Database DropViz カイコ参照トランスクリプトームデータ H-ANGEL |
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レコード管理者:
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Integbio Database Catalog |
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レコードの由来:
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レコード公開日:
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2022-04-28 |
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レコード最終更新日:
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2022-04-28 |
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本レコードの利用条件:
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Creative Commons CC0 license |
