MSDB: MicroSatellite DataBase
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| 運用機関名: | CSIR-Centre for Cellular & Molecular Biology (CCMB) |
| 運用機関所在国・地域: | インド |
| 説明: | マイクロサテライト（単純反復配列）のデータベースです。12種のモデル生物を含む4万を超える生物種について、SSRの染色体位置、繰り返しの種類、繰り返しの長さ、関連遺伝子の情報などを収録しています。UCSCやRefSeq、GenBankからのデータを使用して定期的にアップデートされています。モデル生物を選択するクイックリンクのほか、種名による検索から生物ごとのSSRのデータを見られます。 |
| 生物種: | |
| タグ （対象）: | ゲノム/遺伝子, 個体/種 |
| タグ (データの種類): | 配列 |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | PubMed ID: DOI: |
| 言語: | 英語 |
| 稼動状況: | 稼動中 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | https://data.ccmb.res.in/msdb/ |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明: | ― |
| データベースの利用許諾へのリンク: | ― |
| データベースの使い方 | https://data.ccmb.res.in/msdb/ |
| データベースの連絡先: | https://data.ccmb.res.in/msdb/ |
| API / SPARQL endpoint: | ― |
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LSDBアーカイブへのリンク:
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MEDALSデータベース便覧へのリンク:
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統合TVへのリンク:
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FAIRsharingへのリンク:
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類似データベース:
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SSRome Integrative and Conjugative Elements in Bacteria Strawberry GARDEN Aspergillus Genomes Comparative Fungal Genomics Platform CEBESゲノムデータベース Legionella pneumophila genome database メタゲノム解析用リファレンス16S RNA配列データセット The Human OligoGenome Resource: A Database for Customized Targeted Resequencing Covering the Human Genome CAGm |
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レコード管理者:
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Integbio Database Catalog |
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レコードの由来:
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レコード公開日:
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2022-04-28 |
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レコード最終更新日:
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2022-04-28 |
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本レコードの利用条件:
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Creative Commons CC0 license |