SSRome
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| 運用機関名: | Agricultural Genetic Engineering Research Institute |
| 運用機関所在国・地域: | エジプト |
| 説明: | マイクロサテライトのデータベースです。生物種ごとにさまざまなSSRやマイクロサテライトマーカーの配列を収集しています。種名と繰り返しの型を指定すると、primer IDごとに、SSRのある配列のNCBI ID、Primer配列、SSRの繰り返し回数と配列、遺伝子産物の長さ、NCBIやGenBankへのリンクなどがリストされます。遺伝子上、非遺伝子上、ミトコンドリアおよび葉緑体ゲノム上のSSRが検索できます。ユーザ自身でアップロードした配列について、SSRの特徴を解析したり、データベース内のSSRと比較したりすることもできます。 |
| 生物種: | |
| タグ （対象）: | 遺伝的多様性, ゲノム/遺伝子, DNA, 細胞/オルガネラ, 個体/種 |
| タグ (データの種類): | 配列, 手法 |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | PubMed ID: DOI: |
| 言語: | 英語 |
| 稼動状況: | 稼動中 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | http://mggm-lab.easyomics.org/cdownload/Download.php |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明: | ― |
| データベースの利用許諾へのリンク: | ― |
| データベースの使い方 | http://mggm-lab.easyomics.org/Manual.pdf |
| データベースの連絡先: | http://mggm-lab.easyomics.org/contact.php |
| API / SPARQL endpoint: | ― |
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LSDBアーカイブへのリンク:
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MEDALSデータベース便覧へのリンク:
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統合TVへのリンク:
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FAIRsharingへのリンク:
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類似データベース:
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CAGm MSDB UgMicroSatdb MICAS InSatDb Drosophila polymorphism database DSMNC real-time quantitative PCR Primer Database DBcherry Mum GARDEN |
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レコード管理者:
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Integbio Database Catalog |
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レコードの由来:
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レコード公開日:
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2020-04-22 |
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レコード最終更新日:
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2020-04-22 |
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本レコードの利用条件:
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Creative Commons CC0 license |