OpenProt
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| 運用機関名: | Université de Sherbrooke |
| 運用機関所在国・地域: | カナダ |
| 説明: | Open reading frames (ORFs)のデータベースです。真核生物10種の30コドン以上のORFについて、既知のタンパク質（RefProt）、新規予測アイソフォーム（Isoform）、代替ORFによる新規予測タンパク質（AltProt）についてアノテーションを付与しています。また質量分析やリボソームプロファイリングの検出、タンパク質の相同性、機能ドメインの予測など、各タンパク質の裏付けとなる証拠も収録しています。 種間でのBLAST検索が可能です。 |
| 生物種: | , , , , , , , , , |
| タグ （対象）: | タンパク質, ゲノム/遺伝子 |
| タグ (データの種類): | 配列, 発現 |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | PubMed ID: DOI: |
| 言語: | 英語 |
| 稼動状況: | 稼動中 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | https://openprot.org/p/download |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明: | ― |
| データベースの利用許諾へのリンク: | ― |
| データベースの使い方 | https://openprot.org/p/help |
| データベースの連絡先: | https://openprot.org/p/about |
| API / SPARQL endpoint: | ― |
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LSDBアーカイブへのリンク:
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MEDALSデータベース便覧へのリンク:
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統合TVへのリンク:
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FAIRsharingへのリンク:
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類似データベース:
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EpoDB DART CREB Target Gene Database DeinoBase mycoCLAP Newt-omics SEVENS ARTADE2 予測遺伝子モデル データベース GPIアンカー型タンパク質候補遺伝子データベース AlliumTDB |
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レコード管理者:
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Integbio Database Catalog |
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レコードの由来:
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レコード公開日:
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2019-11-19 |
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レコード最終更新日:
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2019-11-19 |
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本レコードの利用条件:
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Creative Commons CC0 license |