AlliumTDB
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| 運用機関名: | 公益財団法人 かずさDNA研究所 (J-Globalへのリンク) |
| 運用機関所在国・地域: | 日本 |
| 説明: | ネギ属のトランスクリプトームデータベースです。次世代シークエンサーによるRNA-Seqで、日本ネギ（A. fistulosum, FF）、Shallot (A. cepa Aggregatum group, AA)、Shallot由来の余分な染色体を持つ日本ネギの一染色体添加型系統（monosomic addition lines; MALs）、野生種（A. roylei）を材料に葉、球根、根、茎などを解析した結果を収録しています。遺伝子ごとに、配列、発現プロファイル、公開DBに対するBLAST検索データ、各データセット間での相同遺伝子の情報を閲覧できます。BLAST検索、キーワード検索が可能です。 |
| 生物種: | , , , |
| タグ （対象）: | ゲノム/遺伝子 |
| タグ (データの種類): | 配列, 発現 |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | ― |
| 言語: | 英語 |
| 稼動状況: | 稼動中 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | http://alliumtdb.kazusa.or.jp/list.html |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明: | ― |
| データベースの利用許諾へのリンク: | ― |
| データベースの使い方 | ― |
| データベースの連絡先: | ― |
| API / SPARQL endpoint: | ― |
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LSDBアーカイブへのリンク:
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MEDALSデータベース便覧へのリンク:
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統合TVへのリンク:
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FAIRsharingへのリンク:
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類似データベース:
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IMORI Newt-omics CAGE Basic Viewer DBSCR DBTBS MachiBase HBT FiT-DB Melonet DB DAIZUbase |
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レコード管理者:
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Integbio Database Catalog |
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レコードの由来:
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レコード公開日:
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2019-01-08 |
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レコード最終更新日:
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2019-01-08 |
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本レコードの利用条件:
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Creative Commons CC0 license |