DBSCR: Database of transcriptional regulation in Streptomyces coelicolor and its closest relatives
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| 運用機関名: | 国立研究開発法人理化学研究所 (J-Globalへのリンク) |
| 運用機関所在国・地域: | 日本 |
| 説明: | 抗生物質生産菌である放線菌Streptomyces coelicolor A3(2)とその近縁種の転写制御に関するデータベースです。転写因子、被制御遺伝子、転写開始点のシーケンスや機能、遺伝子位置などのアノテーション情報を、公開された文献から手動で抽出し、掲載しています。「Transcription factors」、「Regulated genes」、「Revised translation start sites (TLSs) 」のリストからデータをブラウズできます。また、キーワード、シーケンス、weight matrixを使用した探索も可能です。 |
| 生物種: | , , , , , , |
| タグ （対象）: | ゲノム/遺伝子 |
| タグ (データの種類): | 配列, 発現 |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | ― |
| 言語: | 英語 |
| 稼動状況: | 稼動中 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | ― |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明: | ― |
| データベースの利用許諾へのリンク: | ― |
| データベースの使い方 | ― |
| データベースの連絡先: | ― |
| API / SPARQL endpoint: | ― |
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LSDBアーカイブへのリンク:
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MEDALSデータベース便覧へのリンク:
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統合TVへのリンク:
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FAIRsharingへのリンク:
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類似データベース:
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DBTBS Newt-omics AlliumTDB IMORI MachiBase CAGE Basic Viewer MacroArray Analysis Page of Mesorhizobium loti MAFF303099 DBTGR ARTADE2 予測遺伝子モデル データベース EpoDB |
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レコード管理者:
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Integbio Database Catalog |
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レコードの由来:
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レコード公開日:
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2015-03-10 |
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レコード最終更新日:
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2015-04-02 |
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本レコードの利用条件:
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Creative Commons CC0 license |