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hGTOP: H Genome TO Protein structures and functions
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| 運用機関名: | 情報・システム研究機構 国立遺伝学研究所 (J-Globalへのリンク) |
| 運用機関所在国・地域: | 日本 |
| 説明: | hGTOPはヒト、マウス、ラットのゲノムに含まれる蛋白質の構造アノテーションデータベースです。生物種を指定し、キーワードによる検索が可能です。予測２次構造や天然変性領域、モチーフなどの情報およびPDB、SCOP、Pfam、Swiss-Protに対する相同性検索の結果が一覧できます。また、約170種のモデル生物におけるホモログの情報を階層表示として見ることができます。関連サイトGTOP: https://integbio.jp/dbcatalog/record/nbdc00089 には1000以上の生物種データが含まれます。 |
| 生物種: | , , |
| タグ （対象）: | タンパク質 |
| タグ (データの種類): | 配列, 3D構造, 分類 |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | ― |
| 言語: | 英語 |
| 稼動状況: | 休止 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | ― |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明: | ― |
| データベースの利用許諾へのリンク: | ― |
| データベースの使い方 | http://pford.info/hGTOP/tutorial.jsp |
| データベースの連絡先: | ― |
| API / SPARQL endpoint: | ― |
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LSDBアーカイブへのリンク:
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MEDALSデータベース便覧へのリンク:
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統合TVへのリンク:
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FAIRsharingへのリンク:
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類似データベース:
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Sequence-Structural Templates of Single-member Superfamilies ArchDB Evolutionary Trace Server ProtoNet CATH UniLectin MEROPS SitEx database of eukaryotic protein functional sites MoonProt Evolutionary Trace |
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レコード管理者:
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Integbio Database Catalog |
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レコードの由来:
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レコード公開日:
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2019-07-02 |
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レコード最終更新日:
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2019-07-02 |
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本レコードの利用条件:
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Creative Commons CC0 license |