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SitEx database of eukaryotic protein functional sites: SitEx
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| 運用機関名: | The Federal Research Center Institute of Cytology and Genetics Lab, Novosibirsk State University |
| 運用機関所在国・地域: | ロシア連邦 |
| 説明: | 真核生物のタンパク質機能部位に関する情報を含むデータベースです。機能部位におけるアミノ酸配列と位置を、コーディング遺伝子のエクソン構造との関連とともに収録しています。PDB ID、生物種、リガンド、エキソンの長さなどによる検索のほか、BLASTやPDBファイルによる検索も可能です。タンパク質進化におけるシャッフリングに関与するエクソンを発見するため、またはタンパク質工学実験を設計するために使用することができます。 |
| 生物種: | , , , , , , , , , , , , , , , , , |
| タグ （対象）: | ゲノム/遺伝子, タンパク質 |
| タグ (データの種類): | 配列, 分類, 3D構造 |
| 論文等 (PubMed ID/DOI): | PubMed ID: DOI: |
| 言語: | 英語 |
| 稼動状況: | 休止 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク: | ― |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明: | ― |
| データベースの利用許諾へのリンク: | ― |
| データベースの使い方 | ― |
| データベースの連絡先: | ― |
| API / SPARQL endpoint: | ― |
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LSDBアーカイブへのリンク:
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MEDALSデータベース便覧へのリンク:
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統合TVへのリンク:
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FAIRsharingへのリンク:
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https://fairsharing.org/10.25504/FAIRsharing.5mr9c5 |
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類似データベース:
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MoonProt ProtoNet hGTOP CoDNaS CATH Protein Structure Classification OrtholugeDB ArchDB SCOP2 Sequence-Structural Templates of Single-member Superfamilies Protein Cluster |
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レコード管理者:
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See the corresponding part in the FAIRsharing record. |
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レコードの由来:
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 (2018-12-21)
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レコード公開日:
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2019-03-28 |
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レコード最終更新日:
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2020-07-09 |
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本レコードの利用条件:
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Creative Commons Attribution and Share-alike (CC-BY-SA) International 4.0 license |